育寧視野丨從個人基因組圖譜優化藥物預測

【摘要】
癌癥患者往往表現出異質性藥物反應，因此只有一小部分患者對特定抗癌藥物敏感。隨著通過下一代測序進行大規模基因組分析的可用性，現在對單個患者的整個轉錄組和基因組進行分析以確定其獨特的基因突變和差異表達基因在經濟上是可行的，這些基因被認為是導致異質性藥物反應的原因。雖然亞型分析已經確定了具有共同生物標志物的患者亞組，但沒有有效的方法精確可靠地預測個體患者的藥物反應。在此，我們提出了一種新的計算算法，根據個人基因組圖譜以及藥物基因組學和藥物敏感性數據預測個體患者的藥物反應。具體而言，從癌癥數據庫中的藥物敏感性基因組學中獲得了50多種癌癥的600多個癌癥細胞系（視為個體患者）及其對75種藥物的反應。藥物特異性敏感性特征是通過單個細胞系對特定藥物的反應的基因組圖譜變化來確定的。通過整合來自其他細胞系的投票，預測了單個細胞系的最佳藥物。實驗結果表明，所提出的藥物預測算法可以大大提高為個體患者尋找最佳藥物的可靠性，從而成為腫瘤治療精確醫學基礎設施的關鍵組成部分。

 

 

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